福建檔案局
制訂福建檔案事業發展的長遠規劃和年度計劃，并組織實施。
監督、指導全省、市各級機關、團體、企業事業單位和其他組織的檔案工作和各級檔案的工作。
提出福建鑒定檔案原則和標準、研究、審查有關檔案的保管價值、保管期限等方面的問題，監督檔案文件的銷毀。
下屬機構
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業務法規科
研究制訂福建檔案業務工作的長遠規劃和年度計劃，研究制訂全市檔案工作的政策性文件和規章制度，并組織實施。
宣傳、貫徹福建檔案工作法律、法規、依法對全市檔案工作進行監督、檢查、依法處理違法案件。
負責對福建各級各類檔案館、黨政機關、群團機關、社會組織、企業事業單位的檔案工作進行業務指導。
負責福建各類檔案館（室）檔案管理現代化的技術指導。負責檔案學會的日常工作。
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辦公室
負責福建檔案局（館）日常工作的綜合協調。
負責福建檔案局（館）的公文處理、會計組織、保密統計、情況綜合、宣傳報道、信息反饋等工作。
負責福建檔案局機關工會、女工、計生工作。
負責福建檔案局（館）財務和行政后勤工作。
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教育科
負責福建檔案人員的專業教育、短期培訓。
負責福建檔案系列職稱評定工作。
負責福建檔案局機關職工的思想教育工作和干部、人事、勞資工作。
負責福建紀檢、監督工作。
